يحتوي المعهد العالي للصيد البحري وتربية الأحياء المائية ببنزرت على :
- ·وحدة تجريبية لتفريخ القوقعيات موصولة بمحطّة ضخ مياه البحر و قاعة لتربية الطحالب المجهرية في اطار الشراكة مع دولة كوريا الجنوبية
- ·مخبر الأبحـاث في مجال بيولوجيا الأحياء المائية.
- مخبر خاص بتكنولوجيـا الصناعـات الغـذائيـة الموجّهة لمنتجات الصيد البحري والتربية المائيّة مجهّـز بأحدث الوسائـل في إطار الشراكة مع المجمع المهني المشترك لمنتوجات الصيد اليحري
- مخبر تقنيات و علوم التبريد
- مخبر محاكات الملاحة و الميتيورولوجيا
- مركب بحث ،صيد ساحلي واستغلال القوقعيات
- وحدة البحث: استغلال الأوساط المائية.